Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G360500.1
Synonym PGSIP1, GUX1, Sb03g040240
Functional annotation glycosyl transferase, putative, expressed
UniProt C5XQF4
Pfam PF01501
Panther DB PTHR11183 PTHR11183:SF45
NCBI CDD KOG1950; Glycosyl transferase, family 8 - glycogenin
KEGG Orthology K00750; GYG1, glycogenin
Gene Ontology GO:0016757; transferase activity, transferring glycosyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18660 : plant glycogenin-like starch initiation protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g65780.1 : glycosyl transferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000965
Brachypodium PNT68833 , PNT68832 , KQJ99884 , KQJ99885 , KQJ99886 , KQJ99881 , KQJ99882 , KQJ99883 , KQJ85533
Barley -
Wheat TraesCS3B02G414000 , TraesCS4B02G301200 , TraesCS5A02G067100 , TraesCS5D02G078300 , TraesCS4D02G299500 , TraesCS5B02G074000 , TraesCS4A02G004100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G124766 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic003G360500--Sobic003G008400 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G360500--Sobic005G080075 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G360500--Sobic003G254400 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G360500--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G360500--Sobic010G064050 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G360500--Sobic003G318600 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G360500--Sobic002G082350 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic003G360500--Sobic009G073200 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic003G360500--Sobic008G191800 Sobic003G008400--Sobic005G080075 Sobic003G008400--Sobic003G254400 Sobic003G008400--Sobic001G100650 Sobic003G008400--Sobic010G064050 Sobic003G008400--Sobic003G318600 Sobic003G008400--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic003G360500 Sobic003G008400--Sobic009G073200 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic003G008400--Sobic001G413400 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic005G080075--Sobic001G413400 Sobic003G254400--Sobic003G008400 Sobic003G254400--Sobic005G080075 Sobic003G254400--Sobic001G100650 Sobic003G254400--Sobic010G064050 Sobic003G254400--Sobic003G318600 Sobic003G254400--Sobic002G082350 Sobic003G254400--Sobic003G360500 Sobic003G254400--Sobic009G073200 Sobic003G254400--Sobic001G413400 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic003G318600--Sobic003G008400 Sobic003G318600--Sobic003G254400 Sobic003G318600--Sobic005G080075 Sobic003G318600--Sobic001G100650 Sobic003G318600--Sobic010G064050 Sobic003G318600--Sobic002G082350 Sobic003G318600--Sobic003G360500 Sobic003G318600--Sobic009G073200 Sobic003G318600--Sobic001G413400 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic002G082350--Sobic007G145300 Sobic009G073200--Sobic010G064050 Sobic009G073200--Sobic001G100650 Sobic009G073200--Sobic005G080075 Sobic009G073200--Sobic002G082350 Sobic009G073200--Sobic003G008400 Sobic009G073200--Sobic003G254400 Sobic009G073200--Sobic003G318600 Sobic009G073200--Sobic003G360500 Sobic009G073200--Sobic002G313850 Sobic008G191800--Sobic002G082350 Sobic008G191800--Sobic010G064050 Sobic008G191800--Sobic001G100650 Sobic008G191800--Sobic005G080075 Sobic008G191800--Sobic003G008400 Sobic008G191800--Sobic009G073200 Sobic008G191800--Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G254400 Sobic008G191800--Sobic003G318600
Octagon: transcription factors


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